Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms