Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00597Q9H2U6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00597Q9H2U6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00597Q9H2U6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00597Q9H2U6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00597Q9H2U6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00597Q9H2U6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00597Q9H2U6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00597Q9H2U6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LINC00597Q9H2U6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00597Q9H2U6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms