Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCOLN1Q9GZU1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCOLN1Q9GZU1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms