Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM31Q9BZY9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM31Q9BZY9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM31Q9BZY9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM31Q9BZY9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM31Q9BZY9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms