Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUXAP7-201ENST00000431038 689 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 WFDC13-201ENST00000305479 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 DSCR10-201ENST00000432141 860 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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KRTAP9-2Q9BYQ4 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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KRTAP9-2Q9BYQ4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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KRTAP9-2Q9BYQ4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC084759.2-202ENST00000557976 1053 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP9-2Q9BYQ4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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