Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PACSIN1Q9BY11 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN1Q9BY11 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms