Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF17Q9BXT8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms