Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC94Q9BW85 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms