Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IFT27Q9BW83 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT27Q9BW83 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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