Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
THUMPD2Q9BTF0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms