Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIKE1Q9BRV8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms