Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms