Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms