Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOQ99835 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOQ99835 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOQ99835 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOQ99835 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOQ99835 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOQ99835 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMOQ99835 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMOQ99835 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOQ99835 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOQ99835 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOQ99835 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOQ99835 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOQ99835 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOQ99835 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOQ99835 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOQ99835 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOQ99835 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOQ99835 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOQ99835 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOQ99835 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOQ99835 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOQ99835 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOQ99835 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMOQ99835 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMOQ99835 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMOQ99835 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMOQ99835 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMOQ99835 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMOQ99835 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMOQ99835 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMOQ99835 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMOQ99835 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMOQ99835 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMOQ99835 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMOQ99835 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMOQ99835 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMOQ99835 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMOQ99835 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMOQ99835 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms