Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PIK3R4Q99570 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIK3R4Q99570 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms