Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms