Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK5RAP2Q96SN8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms