Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
IFT140Q96RY7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
IFT140Q96RY7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
IFT140Q96RY7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms