Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UIMC1Q96RL1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms