Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF13CQ96RJ3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF13CQ96RJ3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms