Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARXQ96QS3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms