Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA5Q96PV4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA5Q96PV4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms