Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SYNGAP1Q96PV0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms