Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARAP1Q96P48 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARAP1Q96P48 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms