Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD27Q96NW4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD27Q96NW4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms