Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PRRC1Q96M27 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms