Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HHIPL1Q96JK4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HHIPL1Q96JK4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms