Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCC12Q96J65 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms