Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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FAM46AQ96IP4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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FAM46AQ96IP4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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FAM46AQ96IP4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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FAM46AQ96IP4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM46AQ96IP4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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