Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BORCS6Q96GS4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BORCS6Q96GS4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms