Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MFSD3Q96ES6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms