Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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FAM3DQ96BQ1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
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FAM3DQ96BQ1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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FAM3DQ96BQ1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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FAM3DQ96BQ1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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FAM3DQ96BQ1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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FAM3DQ96BQ1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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FAM3DQ96BQ1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3DQ96BQ1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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