Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP4Q969X6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms