Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPS3Q969F9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms