Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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GTF3C6Q969F1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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GTF3C6Q969F1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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GTF3C6Q969F1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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