Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DPF3Q92784 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DPF3Q92784 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DPF3Q92784 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DPF3Q92784 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DPF3Q92784 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DPF3Q92784 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DPF3Q92784 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DPF3Q92784 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DPF3Q92784 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DPF3Q92784 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DPF3Q92784 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DPF3Q92784 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DPF3Q92784 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms