Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNRQ92752 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNRQ92752 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNRQ92752 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNRQ92752 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNRQ92752 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNRQ92752 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRQ92752 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRQ92752 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRQ92752 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRQ92752 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRQ92752 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRQ92752 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRQ92752 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRQ92752 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRQ92752 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRQ92752 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNRQ92752 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TNRQ92752 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNRQ92752 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNRQ92752 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNRQ92752 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNRQ92752 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNRQ92752 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNRQ92752 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNRQ92752 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRQ92752 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRQ92752 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRQ92752 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRQ92752 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRQ92752 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRQ92752 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRQ92752 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRQ92752 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRQ92752 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRQ92752 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRQ92752 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRQ92752 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRQ92752 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRQ92752 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRQ92752 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNRQ92752 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNRQ92752 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNRQ92752 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNRQ92752 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNRQ92752 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNRQ92752 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNRQ92752 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TNRQ92752 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNRQ92752 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNRQ92752 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNRQ92752 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNRQ92752 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNRQ92752 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNRQ92752 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNRQ92752 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNRQ92752 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNRQ92752 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TNRQ92752 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNRQ92752 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNRQ92752 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TNRQ92752 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNRQ92752 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNRQ92752 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNRQ92752 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNRQ92752 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNRQ92752 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TNRQ92752 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TNRQ92752 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TNRQ92752 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNRQ92752 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNRQ92752 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TNRQ92752 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNRQ92752 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNRQ92752 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNRQ92752 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNRQ92752 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNRQ92752 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNRQ92752 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNRQ92752 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNRQ92752 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNRQ92752 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TNRQ92752 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TNRQ92752 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNRQ92752 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNRQ92752 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNRQ92752 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNRQ92752 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNRQ92752 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNRQ92752 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNRQ92752 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNRQ92752 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNRQ92752 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNRQ92752 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TNRQ92752 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNRQ92752 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNRQ92752 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNRQ92752 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNRQ92752 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNRQ92752 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms