Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNKSR2Q8WXI2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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