Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3RF3Q8TEJ3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms