Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLHDC4Q8TBB5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC4Q8TBB5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms