Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
BEST2Q8NFU1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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