Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC155Q8N6L0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC155Q8N6L0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms