Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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CLDN19Q8N6F1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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CLDN19Q8N6F1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLDN19Q8N6F1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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CLDN19Q8N6F1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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CLDN19Q8N6F1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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CLDN19Q8N6F1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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CLDN19Q8N6F1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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CLDN19Q8N6F1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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CLDN19Q8N6F1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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CLDN19Q8N6F1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN19Q8N6F1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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