Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAP2Q8IXW5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms