Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC6Q8IVU3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms