Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NME9Q86XW9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms