Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC84Q86UT8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms