Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms