Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC129Q6ZRS4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms