Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDZRN4Q6ZMN7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDZRN4Q6ZMN7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms